Du solltest die USB-Speicher mal händisch durchsuchen. Du musst Dir aber alle Dateien anzeigen lassen.

Damit Du nicht ständig mit SHIFT den Autorun unterdrücken musst, kann man den auch global abschalten - bei Vista ist das ne einfache Sache - in der Systemsteuerung:
Hardware und Sound => CDs und andere Medien automatisch wiedergeben => alles deaktivieren (keine Aktion ausführen)

Ist eine autoruninf auf einem Stick oder einer USB-Platte deutet das auf einen Infizierung hin, ein Schädling der diese Funktion missbrauchen will. Die autorun.inf und die Dateien, die automatisch gestartet werden sollen, müssen weg. Welche das sind steht in der autorun.inf.