Habe soeben versucht die ISODatei mit IMGBurn auf einen Rohling zu brennen. Jedoch geht der Brennvorgang nur bis 99% "Synchronising cache"
Das Laufwerk macht komische Geräusche und es passiert seit 20 Minuten gar nichts mehr.
Gibt es auch eine andere Möglichkeit MBR zu fixen?

Nein eine zuverlässigere Methode nicht. Man kann mit mbrcheck fixen, das klappte aber oft nicht besonders.
Probier einen anderen Rohling oder nimm einen anderen Brenner.