Ich hatte dieses offenbar verbreitete Problem.
Mehrere Bereinigungsversuche (AntiVir, Ad-Aware, Malwarebytes´ Anti-Malware) konnten keine Abhilfe schaffen.
Kurz zuvor war mir jedoch unter TuneUp Utilities 2010 ein verdächtiges Programm aufgefallen, das beim Systemstart automatisch gestartet wird:

C:\Dokumente und Einstellungen\[Benutzername]\Anwendungsdaten\Dvdmod\deptor.exe

(Ich nutze Windows XP.)

Nachdem ich das Verzeichnis Dvdmod samt Inhalt im DOS-Modus gelöscht habe, war das Problem behoben. (Unter Windows löschen funktioniert nicht - nach dem nächsten Systemstart ist die Datei wieder da.) Dies ist jetzt einige Wochen her, und ich hatte keine Probleme mehr.

Vielleicht hilft mein Tipp dem einen oder anderen weiter und erspart ein komplettes Neueinrichten des Rechners.

Vielleicht gibt mir mal jemand eine Rückmeldung, ob er/sie auf die gleiche Weise das Problem lösen könnte. Würde mich freuen.

woher weist du, dass der trojaner keine versteckten prozesse instaliert hatt? woher weist du, dass er keine enderungen vorgenommen hatt, die ne neuinfektion erleichtern?
usw. usw.
rufe deine bank an, lasse das onlinebanking sperren.
sichere dann deine daten.
dann gebe ich dir tipps, wie du das system neu aufsetzen kannst und richtig absicherst.
nur dann kannst du sicher sein das das system sauber ist und nicht eines tages das konto leer.