1. War denn nun noch was böses drauf, was wir innerhalb der letzten zwei Tage gelöscht haben?

Naja, ein paar Sachen wurden gefixt. Muss ich das jetzt im Detail erläutern?

2. Ich habe ganz zu Beginn das rkill und Malewarebytes mit einem Stick auf meinen Rechner gebracht, weil ich nicht mehr ins Internet konnte. Muss ich den Stick formatieren oder hat der höchstwahrscheinlich gar nichts.

Formatieren? Was ist denn da noch drauf außer rkill und MBAM? Oder hast Du die befürchtung, dass der durch den verseuchten Rechner infiziert sein könnte?
Wenn ja, lass den Stick mal angesteckt und führe den Flash Disinfector aus.

3. Kannst Du irgendwas sehen, was ich wpmöglich zu viel ausgeschaltet habe, dass mein WLAN nicht mehr funktioniert (=> Fehlermeldung : Der Abhängigkeitsdienst oder die Abhängigkeitsgruppe konnte nicht gestartet werden.)

Google kann helfen => Lösung: Der Abhängigkeitsdienst oder die Abhängigkeitsgruppe konnte nicht gestartet werden.

4. Kann ich alle Programme und files der letzten zwei Tage löschen oder sollte ich die zu irgendeinem Zweck aufbewahren

Wozu voreilig löschen, was stört Dich jetzt im einzelnen?

5. Kannst Du mir eine Empfehlung geben, wie ich mich zukünftig besser schütze, d.h. welche Programme ganz konkret soll ich verwenden? Macht es z.B. Sinn den CCleaner (der hat mich beeindruckt ) monatlich drüberlaufen zu lassen?
Allgemeine Hinweise brauche ich keine mehr, hab schon einiges dazu gelesen. Ich werde jetzt auch noch einen Benutzer mit wenigen Rechten anlegen, mit dem ich dann zukünftig ins Internet gehe.

Programme brauchst Du weniger. Du musst Dein Verhalten bzw. Sicherheitskonzept optimieren.
Halte Dich am besten grob an diese fünf Regeln:

1) Sei misstrauisch im Internet und v.a. bei unbekannten E-Mails, sei vorsichtig bei der Herausgabe persönlicher Daten!!
2) Halte Windows und alle verwendeten Programme immer aktuell
3) Führe regelmäßig Backups auf externe Medien durch
4) Arbeite mit eingeschränkten Rechten
5) Nutze sichere Programme wie zB Opera oder Firefox zum Surfen statt den IE, zum Mailen Thunderbird statt Outlook Express - E-Mails nur als reinen text anzeigen lassen

Alles noch genauer erklärt steht hier => Kompromittierung unvermeidbar?

Zu 1: Nein, musst Du nicht, die Frage war nur, OB noch was drauf war. Die Antwort ist: ja.

Zu 3: Google hatte ich schon bedient, aber genau der link hat nicht zum Ziel geführt. Aber ich bekomm das noch irgendwie raus.

Zu 4: Mich stört nichts im einzelnen, habe halt nur gerne etwas Ordnung auf dem Rechner. Aber wenn aufbewahren sinnvoll ist, dann mache ich das.

Zu 5: Hm, ich hätte gerne irgendwie regelmäßig mein System überprüft mit CCleaner oder Malewarebytes oder was auch immer.

Naja, dann haben vielen Dank für Deine Zeit und Deine Mühe!

Grüße
Markus

Zu 5: Hm, ich hätte gerne irgendwie regelmäßig mein System überprüft mit CCleaner oder Malewarebytes oder was auch immer.

Da spricht ja auch nichts gegen! Du darfst halt eben, nur weil Du Virenscanner einsetzt, nicht hirn-/gedankenlos auf alles herumklicken, weil "der Virenscanner ja schützt"